Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms