Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpm3Q5F4S9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms