Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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