Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syne3Q4FZC9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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