Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms