Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161 ms