Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Elf3Q3UPW2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms