Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms