Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms