Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6cQ3UHC0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms