Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam35aQ3UEN2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam35aQ3UEN2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms