Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms