Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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