Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fndc4Q3TR08 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Fndc4Q3TR08 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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