Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trappc10Q3TLI0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trappc10Q3TLI0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trappc10Q3TLI0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trappc10Q3TLI0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc10Q3TLI0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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