Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms