Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc162pQ0VG85 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms