Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Smim24Q0VG18 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Smim24Q0VG18 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim24Q0VG18 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Smim24Q0VG18 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Smim24Q0VG18 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Smim24Q0VG18 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Smim24Q0VG18 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smim24Q0VG18 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms