Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms