Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spata18Q0P557 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spata18Q0P557 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms