Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms