Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf541Q0GGX2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms