Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms