Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
NrepQ07475 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NrepQ07475 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms