Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms