Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms