Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax5Q02650 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms