Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mc1rQ01727 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms