Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms