Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms