Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms