Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms