Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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