Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme1P97371 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme1P97371 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms