Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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