Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccl21cP86793 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccl21cP86793 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccl21cP86793 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccl21cP86793 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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