Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tubg1P83887 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms