Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx1P80205 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms