Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms