Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd13P70217 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd13P70217 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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