Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps3P62908 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps3P62908 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms