Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms