Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps29P62274 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps29P62274 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms