Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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