Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pcbp1P60335 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms