Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dpf3P58269 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms