Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp25P57080 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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