Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Cldn18P56857 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms