Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GferP56213 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms