Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rad23bP54728 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rad23bP54728 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rad23bP54728 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rad23bP54728 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rad23bP54728 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms